Mutasi dan Rotasi karyawan adalah suatu proses penataan Sumberdaya Manusia yang ada di lingkungan Universitas Surabaya oleh Direktorat SDM atas dasar berbagai pertimbangan (seperti Peningkatan Kinerja Individu, Pemerataan Beban Kerja, maupun Penataan Struktur Organisasi) sebagai bentuk upaya pimpinan perguruan tinggi untuk mengoptimalkan kinerja dari setiap Unit Kerja yang ada di lingkungan Universitas Surabaya.